Bastian er en liten og tykk tiåring som ofte har det trist og vanskelig. Men hvis livet blir for plagsomt, drømmer Bastian seg inn i fantasiens verden. En dag finner Bastian en bok i et antikvariat:
Den uendelige historie.
Boken griper fatt i ham. Han gjemmer seg bort på et loft og begynner å lese. Sammen med Bastian føres vi til landet Fantásia. Er dette en magisk bok? Vi møter gleder og sorger vi kjenner fra våre egne liv. Vi vandrer med Bastian i Sørgmodighetens sumper, opplever den frykteligste av all redsel i Ygrámul og skjønnheten i Perelín, Nattens skog.
Den som kommer til landet Fantásia får en medaljong med inskripsjonen Gjør hva du vil. Bastian tolker dette som gjør det du har lyst til. Dermed virvles han inn i eventyrlige begivenheter skapt av hans egen uhemmede fantasi. I Fantásia stilles motsetninger skarpt opp mot hverandre: det vakre og det stygge, det glade og det triste, mot og feighet - alt som gjør livet spennende!
Vennen Atréju hjelper Bastian å finne veien tilbake fra det uendelige fantasiriket. Bastian forstår nå at inskripsjonen på medaljongen kan bety noe sånt som gjør det du kjenner en indre trang til - følg din egen vilje ...