I Mary Queen of Scots utforskes Mary Stuarts turbulente liv. Mary ble dronning av Frankrike som 16-åring og enke som 18-åring. Hun nekter å gifte seg på nytt og drar hjem til Skottland for å kreve sin rett til tronen. Hun gjør også krav på tronen til Elizabeth I, den regjerende dronningen av England. De to dronningene blir rivaler i makt og kjærlighet og tar helt forskjellige valg. Svik, opprør og konspirasjoner driver dem fra hverandre, og hver av dem får smake maktens bitre pris.
. - Aldersgrense 12 år
Etter å ha blitt enke i Frankrike returnerer den unge dronning Mary til Skottland i 1561. Den katolske Mary er tronarvingen til Skottland. Hun er også overbevist om sin rett til den engelske tronen, som for øyeblikket besittes av hennes kusine, den protestantiske dronning Elizabeth I. Dette fører til et intrikat spill med diplomati og trusler, hvor begge hardnakket fastholder at de er den rette tronarvingen. Manipulering, taktiske giftemål og religion blir brukt som skyts i den dramatiske kampen mellom de to usannsynlig mektige kvinnene, som må kjempe mot hverandre og omgivelsene sine i en tid hvor makten vanligvis tilfalt menn.