Alt han ønsker er å forsvinne, men i stedet er nå Jason Bourne jaktet av folkene som gjorde ham til den han er. Han har mistet hukommelsen og kvinnen han elsket, så han kan ikke stoppes av kuler eller en ny generasjon av snikskyttere. Bourne har bare ett mål: å gå tilbake til begynnelsen og finne ut hvem han var. Han reiser fra Moskva, Paris og London til Tanger og New York, mens han forsetter i korstoget for å finne den ekte Jason Bourne, mens han hele tiden må utmanøvrere politi, føderale agenter og Interpol.