Hanna er 16 år gammel. Hun er intellingent, vitebegjærlig, vakker  og opplært til å drepe. Etter å ha gjemt seg i skogene nord for polarsirkelen det meste av livet sitt og blitt trent som en soldat av sin far , blir hun nå sendt tilbake til sivilisasjonen hvor en hensynsløs C.I.A. etterretningsleder er på jakt etter henne for å utslette Hannas eksistens. Samtidig som Hanna får vite om de hendelsene som gjorde henne til en drapsmaskin, må hun slåss for å overleve, og fjerne den ene personen som har det største ansvaret for at hun er blitt det hun nå er.