På den fredelige, japanske øyen Teshima finnes det et helt spesielt bibliotek. Der samles hjerteslagene til alle som besøker øyen. I den lille, isolerte bygningen høres gjenlyden av hjerteslagene til både dagens besøkende og de som levde for lenge siden. Flere mil unna, i den gamle byen Kamakura, møtes to ensomme sjeler: Shuichi er en førti år gammel illustratør som vender tilbake til hjembyen sin for å renovere huset til den nylig avdøde moren, og Kenta er et 8-årig barn som vandrer som en skygge gjennom Shuichis hus. For hver dag som går øker tilliten deres til hverandre, og etter hvert oppdager de at de deler et bånd som vil knytte dem sammen for livet. Reisen vil lede dem til Teshima, og til hjerteslagenes bibliotek.